Szczeć pospolitą stosowano przede wszystkim w leczeniu dny moczanowej, artretyzmu i reumatyzmu. Obecnie jednak roślina ta jest szczególnie popularna w leczeniu boreliozy.
Surowcem zielarskim jest korzeń, jak i Iiście szczeci.
Ekstrakt z tej rośliny działa bakteriobójczo, przeciwzapalnie i, co bardzo istotne, ochronnie na wątrobę – to zasługa kwasów fenolowych i kwasu ursolowego. Zawartość irydoidów z kolei niweluje ból i działa jako naturalny antybiotyk. Szczeć wykazuje również działanie przeciwreumatyczne. Ekstrakt ze szczeci wzmacnia układ odpornościowy. Ma działanie przeciwpasożytnicze, poza tym pomaga niwelować stany zapalne skóry oraz wypryski i zmiany skórne.